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국립농업과학원 유전체 정보를 이용한 대량 유전자 기능 탐색

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dud45
등록일
2009-11-02 10:35:27
조회수
4693
본 연구의 목표는 공개된 아미노산 특허 정보와 genome의 서열 중 미확인 유전자(hypothetical protein or unknown)를 BLASTP 서열 비교 방법을 사용하여 그 중 연구적 가치성 및 신뢰성이 높은 후보군을 선별한 후 그와 관련 정보를 DB화하여 현실적으로 이용가능성이 높은 유용 유전자 DB를 제공 및 이용에 관한 것으로 이를 위해 NCBI(National Center for Biotechnology Information, www.ncbi.nlm.nih.gov) 아미노산 특허 정보와 공개된 genome의 서열 중 미확인 유전자(hypothetical protein or unknown)를 BLASTP 서열 비교 방법을 사용하여 그 중 연구적 가치성 및 신뢰성이 높은 후보군을 선별한 후 그와 관련 정보를 DB화하여 현실적으로 이용가능성이 높은 유용 유전자 DB를 구축하였다. 최근, 분자생물학적 기술이 발전함에 따라 미생물에서 인간에 이르기까지 온간 생물체의 DNA 서열 정보들이 기하급수적으로 늘어나고 있다. 현재 DNA 서열 정보의 기능 예측은 computational program을 이용하고 있다. computational program은 유전자 기능 예측을 하기위해 기능이 확인된 유전자를 예측 기본 자료로 이용하고 신뢰성이 있는 통계 예측 모델로 HMM(hidden markov model)등을 도입하여 유전자 예측 알고리즘을 만들어 유전자의 기능을 예측하였다. 연구자들은 이러한 computational program을 이용한 유전자 기능 예측으로 생성된 결과를 가지고 직접 연구에 적용하기에는 데이터량이 매우 방대하고 잘못 예측된 것도 많다는 사실을 알기 때문에 좀 더 신뢰성을 확보하여 실험에 적합한 후보 유전자 DB를 제공해 주길 원하고 있다. 본 발명은 통계적 알고리즘을 이용한 computational program의 결과에 NCBI(National Center for Biotechnology Information, www.ncbi.nlm.nih.gov) 아미노산 특허 서열 정보와 서열 비교하여 공개된 genome의 서열 중 미확인 유전자에 더욱 연구적 가치성과 신뢰성을 높인 DB를 구축하였다.
작성일:2009-11-02 10:35:27 152.99.82.30

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